Организация, в которой вы проходили курсы по сестринскому делу в косметологии (а не курсы косметолога, как я полагаю), не имеет права отказать в выдаче сертификата на основании "понижения должности". Во-первых,потому что образовательная организация не оперирует понятием "должности", а уж тем более не повышает и не понижает. Отказать на этом основании в выдаче сертификата они не могут.
Полагаю, дело в другом.
В соответствии с Приказом Минздрава №66н осуществлять проф.переподготовку по специальности "Сестринское дело в косметологии" (а именно этим видом образования являются вышеупомянутые курсы) можно только при соответствии лица квалификационным требованиям; для среднего медицинского персонала они установлены Приказом Минздрава РФ №83н. Из этого правила есть исключения, распространяющиеся на случаи, когда лицо не соответствует квал.требованиям, но имеет непрерывный стаж практической деятельности более 5 лет. Однако, описанная ситуация по исключение не подпадает.
Проблема могла возникнуть в связи с тем, что диплом о высшем образовании говорит о подготовке к педагогической профессиональной деятельности (виды см. п.4.3 Приказа Минобрнауки РФ от 03.09.2015 №964, утвердившего ФГОС (уровень: бакалавриат) по направлению "Сестринское дело"), что возможно, по мнению образовательной организации, не означает автоматически наличия среднего образования. Однако, об этом им следовало задуматься при наборе на курсы, при заключении договора об оказании платных образовательных услуг, а не после прохождения обучения.
Свидетельство с оценками не является подтверждением прохождения проф. переподготовки. А наличие сертификата, необходимого для замещения должности среднего мед. персонала (медицинской сестры в косметологии), никак не влияет на "ценность" имеющегося у вас высшего образования, да и вообще выбор вами карьерного пути находится вне сферы интересов образовательной организации. Внимательно прочитайте договор об оказании платных образовательных услуг и требуйте сертификат. Без него работодатель не имеет права вас трудоустроить на должность "медицинской сестры в косметологии". Ссылайтесь на договор, ФЗ "Об образовании в РФ", два упомянутых выше приказа.