Указание наименования услуги (товара), как обязательный реквизит чека, установлено абз.9 п.1 ст. 4.7 ФЗ №54-ФЗ.
Представляется, что исполнение требований одного федерального закона, которым является ФЗ №54-ФЗ, не может являться одновременным нарушением требований другого федерального закона, которым является установивший обязанность соблюдения врачебной тайны ФЗ №323-ФЗ. Передача информации ФНС, получающей и использующей ее в пределах своей компетенции в сфере налогообложения, не может являться разглашением врачебной тайны по смыслу ст. 13 ФЗ-323 и ст.13.14 КоАП РФ.
Напоминаем, что медицинская организация, как субъект оказания услуг населению, вправе использовать в своей деятельности БСО до 01.07.2018, что подробно изложено в статье "Онлайн-кассы: июль приближается".
О разглашении врачебной тайны, как информации с ограниченным доступом, и ответственности за разглашение см. статью "Персональные данные пациента косметологической клиники: правила обработки".