Закрыть
Вход
youtube Telegram Vkontakte
youtube telegram vkontakte

Немецкие ученые предложили новый способ изучения микробиома кожи

25.08.2021
414
1 мин на прочтение
Недостатком предыдущих методов являлся захват большого количества последовательностей ДНК клеток кожи и фрагментов мертвых бактерий, что снижало информативность результата

В обычных культурах, выращиваемых в чашках с агаром, не все бактерии одинаково хорошо развивались и размножались. В результате некоторые виды микроорганизмов могли полностью игнорироваться.

Команда профессора Бидерманна из Клиники дерматологии и аллергологии Технического университета Мюнхена (TUM) разработала метод удаления ДНК нецелевых видов при помощи фермента бензоназы. Он разрушает нуклеотидные цепи на короткие фрагменты. Только живые бактерии, ДНК которых защищена внешней клеточной стенкой, не разрушаются ферментом. Бензоназа уже использовалась ранее для очистки белков.

Отбор кожных бактерий осуществлялся по тому же принципу: генетический материал из клеток кожи или мертвых бактерий расщеплялся ферментом и затем отделялся от образца.

Наши эксперименты показали, что с помощью этого метода мы действительно можем полностью удалить нецелевую ДНК и выбрать микробиом кожи. Использованный процесс, известный как секвенирование 16S, дал очень точную картину состава интактных бактерий

Анализ реальных мазков с кожи был столь же успешным: в образцах не было обнаружено остаточной ДНК мертвых бактерий.

Такой подход в будущих исследованиях может использоваться для поиска микробных биомаркеров при определенных дерматологических заболеваниях, например дерматите и акне. Метод также идентифицирует бактерии, которые могут влиять на течение болезни.

Новый метод уже используется в когортных исследованиях в клинике при университете.

Источники:

  1. https://www.tum.de/en/about-tum/news/press-releases/details/36873/

Комментарии

(0) комментариев
Войти чтобы оставить комментарий

Еще по теме

FDA одобрило препарат для лечения витилиго
Регенеративная медицина
FDA одобрило препарат для лечения витилиго
Препарат ингибитор янус-киназы Opzelura предназначен для лечения несегментарного витилиго у подростк...
Ученые уточнили роль TGF-бета в регенерации тканей
Регенеративная медицина
Ученые уточнили роль TGF-бета в регенерации тканей
Белок контролирует в том числе деление клеток волосяного фолликула. Открытие может помочь в терапии ...